Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms