Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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