Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms