Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Med28Q920D3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms