Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SncbQ91ZZ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncbQ91ZZ3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms