Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms