Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms