Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clptm1Q8VBZ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms