Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms