Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cdc16Q8R349 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cdc16Q8R349 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cdc16Q8R349 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdc16Q8R349 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms