Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc12Q8R344 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms