Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms