Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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