Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec10Q8CF98 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Colec10Q8CF98 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colec10Q8CF98 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec10Q8CF98 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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