Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms