Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras1Q8CEC5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras1Q8CEC5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms