Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms