Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms