Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms