Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim35Q8C006 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim35Q8C006 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim35Q8C006 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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