Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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