Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms