Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms