Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms