Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trmt12Q8BG71 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms