Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms