Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cpped1Q8BFS6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cpped1Q8BFS6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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