Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms