Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms