Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IfneQ80ZF2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms