Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms