Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms