Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms