Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms