Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sys1Q78S06 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms