Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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