Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SpopQ6ZWS8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms