Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms