Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo4Q6PAQ4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms