Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms