Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Soga3Q6NZL0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Soga3Q6NZL0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Soga3Q6NZL0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Soga3Q6NZL0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Soga3Q6NZL0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Soga3Q6NZL0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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