Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SphkapQ6NSW3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms