Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms