Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scaf8Q6DID3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms