Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms