Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Pdzrn3Q69ZS0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Pdzrn3Q69ZS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Pdzrn3Q69ZS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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