Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms