Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Top2bQ64511 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top2bQ64511 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms