Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sf1Q64213 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sf1Q64213 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sf1Q64213 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sf1Q64213 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sf1Q64213 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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