Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim24Q64127 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms